棉花分子育种研究室围绕棉花产业发展需求，以棉花高产为前提，优质、抗逆、轻简化为主攻方向，创制棉花种质资源，培育适宜机械化作业、综合性状优良的棉花新品种，同时将分子育种技术和常规育种方法相结合，开展棉花重要性状的遗传规律研究、发掘重要性状分子标记及功能基因，为棉花产业发展提供品种、技术及理论支撑。研究室负责人张建宏研究员，顾问张香云研究员。成员11人，其中研究员4人，副研究员4人；博士1人，硕士5人。团队先后育成冀棉262、冀1518、冀棉126等高产、抗病、优质、适机采棉花新品种29个，其中国审品种8个。获得植物新品种权9项，发明专利5件，实用新型专利16件，制定地方标准3项。获国家科技进步奖二等奖1项，农业部中华农业科技奖一等奖1项，河北省科技进步奖二等奖5项，其他各类成果奖20余项。在《Theoretical and Applied Genetics》《Frontiers in Plant Science》《中国农业科学》《棉花学报》等刊物发表论文80余篇，出版《棉花新品种与高效植棉生产新技术》等著作6部。